花蓮的吉安鄉在日據時代是大批日本人移民的主要據點，西元1917年時日人為了安定民心在此區建置了「吉野布教所」，即為現今的慶修院。慶修院在當時除了是日人的精神信仰中心外，具備了醫療所、課堂室及喪葬法事服務處等多種功能。

當時布教所所供奉的主神有弘法大師、不動明王及毘沙門天王，建築物外形主要是遵循日本傳統高野山脈寺院的形式，院拜堂四週有迴廊，四周種植各式花草樹木，環靜清幽、雅靜。後因日本戰敗撤離，布教所改由當地居民接手管理，正堂便改奉祀釋迦牟尼佛及觀音菩薩至今。

民國九十二年八月縣政府慎重地完成慶修院的修護工程，將擺放在庭院中具有歷史價值的八十八尊佛像完整地呈現其原貌。目前不但是東部地區保持最完整的日據時期神社古蹟外，更是日本人來台旅遊尋根拜訪的觀光景點之一。